Japonia a devenit al patrulea mare partener comercial al Uniunii Europene, în ceea ce priveşte exporturile agro-alimentare, devansând Rusia.
Uniunea Europeană este un exportator net de produse agro-alimentare în Japonia. Excedentul net al UE în comerţul cu produse agro-alimentar cu statul nipon a fost de aproximativ 5 miliarde de euro în ultimii ani. În perioada noiembrie 2015 - octombrie 2016, valoarea exporturilor comunitare către această ţară a înregistrat o creştere de 0,4 miliarde de euro, atingând valoarea de 6,630 miliarde euro.
În acest moment, Japonia a devenit al al patrulea cel mai important importator de produse agro-alimentare europene, după SUA (care au importat mărfuri din UE în valoare de 20,453 miliarde euro), China (11,169 miliarde euro) şi Elveţia (7,763 miliarde euro), dar înaintea Rusiei (5,460 miliarde euro).
Uniunea Europeană exportă către Japonia în principal carne de porc, vin şi vermut, brânzeturi, băuturi spirtoase şi lichioruri. Valoarea anuală a exporturilor UE către statul nipon a crescut rapid până în 2012, dar de atunci într-un ritm mult mai lent. Negocierile cu privire la un acord comercial bilateral ar putea deschide noi oportunităţi pentru sectorul agro-alimentar comunitar.